摘 要外泌体是多种活细胞主动向胞外分泌的囊泡样小体,广泛存在于各种体液中,多种肿瘤的发生与发展密切相关。本文回顾了近些年外泌体在蛋白质组学上的研究进展,并展望了外泌体在蛋白质组学研究的前景。
关键词 外泌体;分离纯化;蛋白质组学;疾病
外泌体是一类由体内多种活细胞分泌的纳米级的双层膜结构小囊泡,可携带包含亲代细胞信息的核酸、蛋白质和脂质等。外泌体可以存在于各种体液中,如血液,尿液,唾液,胃液和母乳,外泌体可通过传递信息影响靶细胞的功能,激活细胞信号通路,不仅影响细胞的生理状态,而且与多种疾病的发生与发展密切相关。体液中的外泌体蛋白质受血液高丰度蛋白质干扰少、表达稳定,使其较血液中传统的可溶性诊断分子更有意义,具有作为生物学标志物的潜力。
1.外泌体的分离鉴定
1.1外泌体的分离纯化外泌体蛋白质组学研究的前提是获取均匀的无污染的囊泡蛋白产物,所以必须事先对外泌体进行分类纯化。目前科学研究中常用的分离纯化方法有如四种:差速离心法、蔗糖梯度离心法、尺寸排阻法、亲和富集法。蔗糖梯度离心法弥补差速离心法获得外泌体纯度不高的问题,然而蔗糖梯度离心法的前期准备工作十分繁杂,不适合后续大规模的蛋白质组学的分析。所以我们又提出尺寸排阻法和亲和富集法。由于外泌体的尺寸通常为30~nm,因此尺寸排阻法也非常适用于外泌体的分离与纯化。由于外泌体表面带有特殊的膜蛋白质,可以利用抗体与膜蛋白质间的特异性相互作用,可以实现外泌体的亲和富集。1.2外泌体的提取鉴定年殷爱红等人采用超速离心法提取细胞培养液外泌体,经过FASP酶切,收集酶解肽段,通过Easy-NanoLC液相色谱仪和TripleTOF质谱仪液质联用检测外泌体全酶解产物,并通过LC-MS-MS方法,检索Uniprot的HUMAN数据库,设置一级质量偏差10ppm、二级质量偏差20ppm,匹配假阳性率(FDR)<1%,去除匹配肽段<2的蛋白质,结果检索到个匹配蛋白。对蛋白质进行GeneOntology富集分析,分子功能(molecularfunction)相关的蛋白质个,生物过程(biologicalprocess)有关的个,细胞组成(cellular